纖維球過濾器判斷何時反沖洗主要是看水頭損失和出水水質，其次是看濾層上部過濾水面的變化（濾層孔隙率隨過濾時間的延長而不斷降低，過濾速度也隨時間的延長而減小，導致濾層上部過濾水面不斷上升，此時應對纖維球濾料進行反沖洗）。在反沖洗過程中由于濾料之間各種作用力的共同影響，使纖維球相互粘結形成一個整體，如果一開始使用水洗或氣水聯合反沖洗，除了濾層低部少許纖維球濾料處于自由運動狀態外，幾乎整個濾層全部被托起，無法對截留了污染物的纖維球濾料進行有效的反沖洗。如果在反沖洗過程中一開始用氣沖洗，由于纖維濾料相對密度較小，使纖維濾床在反沖洗時難以形成良好的流化狀態，若床層高度與直徑的比值過大或氣速過高或氣體分布不均勻，會發生氣泡合并現象，當氣泡直徑長到與床層直徑相等時氣泡將床層分幾段，形成相互間隔的氣泡層與纖維層，纖維層被氣泡推著向上運動到達上部后氣泡突然破碎，纖維球則分散落下，產生騰涌現象，發生騰涌現象時，不但使得氣-固接觸不均勻，纖維球和器壁間的磨損加劇，而且引起設備振動。
      因此，應選擇在反洗的開始階段將過濾器內注滿反洗水后再進行氣沖，目的是使粘結在一起的纖維球濾料充分沖散開來，接著再進行氣水聯合反沖洗，最后在進行水沖，這樣可以有效的清除纖維球濾料表面上截留的污染物，在反洗完成后應用清水正向清洗幾分鐘，使從纖維球脫落未沖洗出去的污染物散落在床層，以防止其在剛開始過濾過程中影響過濾器的出水水質。
      纖維球濾料氣水反沖洗中各個參數的影響主次順序為：氣沖強度—氣水同沖時間—水沖強度—單水漂洗強度。反沖洗的強度和時間與污水的性質和纖維球的截泥量有關，這需要在實際應用中根據現場情況進行恰當的選擇，反洗時不能將濾球內部所有懸浮物都沖洗干凈作為反洗的終點，通常以反沖出水中懸浮物濃度作為反沖終點。當纖維球過濾器反沖洗后直接降下壓緊裝置，此時部分濾料仍處于懸浮狀態，正常過濾時部分濾料存留在壓緊裝置上，影響過濾效果。因此，建議攪拌反沖洗結束后，先正向過濾幾分鐘，至濾料完全降落后，降下壓緊裝置，進行正常的過濾階段。